《寶可夢傳說Z-A》采用了一個全新的實時對戰(zhàn)系統(tǒng)，不過作為《寶可夢傳說》系列的新作，本作也同樣取消了特性。不過GameFreak對于對戰(zhàn)系統(tǒng)的嘗試很徹底，連前作取消的玩家對戰(zhàn)也加入了回來。根據(jù)電玩迷(dianwanmi.com)編輯了解今天官方公開了《寶可夢傳說Z-A》名為“Z-A對戰(zhàn)俱樂部”（Z-A Battle Club）的玩家4人對戰(zhàn)玩法。

　　根據(jù)GameFreak官方介紹在《寶可夢傳說Z-A》的“Z-A對戰(zhàn)俱樂部”玩法中玩家可以使用3只寶可夢在線上與最多3名玩家進行對戰(zhàn)，4名玩家并非2V2組隊戰(zhàn)，而是彼此1V3的大混戰(zhàn)。玩家可以隨時替換寶可夢，可以使用超級進化，并且寶可夢本身被擊敗后也可以繼續(xù)上場。每局對戰(zhàn)限時3分鐘，以擊敗寶可夢數(shù)量多少定勝負。玩家對戰(zhàn)結(jié)束將會獲得對應的獎勵。

　　“Z-A對戰(zhàn)俱樂部”也采用了天梯積分制，玩家可以通過對戰(zhàn)獲得積分，自初始Z級提升至頂點的A級。每個賽季結(jié)束，也會根據(jù)玩家等級提供額外獎勵，同時每個賽季的獎勵也不同。